BLU | Palazzo d'Arte e Cultura è dotato di un auditorium che, con i suoi 130 posti a sedere, si configura come uno dei migliori spazi polifunzionali presenti nella città di Pisa. L'auditorium è situato al primo piano del palazzo e, pur se collegato agli spazi destinati alle esposizioni temporanee, è accessibile tramite ingresso, scale ed ascensori separati ed indipendenti. Esso è dotato di moderni servizi audiovisivi ed è quindi uno spazio idoneo per seminari, convegni e presentazioni alla stampa di eventi interni ed esterni alla Fondazione.
L'atmosfera accogliente e la funzionalità degli spazi e delle strutture lo rende, inoltre, particolarmente adatto per eventi collettivi a carattere sociale. L'ampio foyer, nel quale è possibile organizzare anche coffee break, aperitivi e rinfreschi, permette un efficiente servizio di accoglienza e registrazione. L'auditorium è accessibile ai disabili